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contacts:croce:croce [2024/03/20 15:56] – [Administrative responsibilities, other] oliviercontacts:croce:croce [2024/05/28 16:06] – [Conferences and communications] olivier
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   * [1] **2006** ; __Croce O.__; Lamarre M.; Christen R. ; Querying the public databases for sequences using complex keywords contained in the feature lines; 7:45 ; //BMC Bioinformatics.// [[http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-7-45|{{ :contacts:doi.png}}]] [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16441875|{{ :contacts:pubmed.gif}}]]   * [1] **2006** ; __Croce O.__; Lamarre M.; Christen R. ; Querying the public databases for sequences using complex keywords contained in the feature lines; 7:45 ; //BMC Bioinformatics.// [[http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-7-45|{{ :contacts:doi.png}}]] [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16441875|{{ :contacts:pubmed.gif}}]]
-===== Conferences and communications ===== +===== Conferences and communications ===== 
- +
-  * **2023** ; Genomic identification of human pathogenic bacteria in the marine environment ; //Colloque LIA-ROPSE 2023 // ; Monaco  +
  
   * **2021 ** ; Guidelines for creating a user-friendly and open-access gene expression database for comparing embryonic development and regeneration in Nematostella vectensis ; // Methods in Molecular Biology // ; Book chapter 39 -Whole Body Regeneration ; O. Croce & E. Rottinger - [[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03437921/|HAL]]   * **2021 ** ; Guidelines for creating a user-friendly and open-access gene expression database for comparing embryonic development and regeneration in Nematostella vectensis ; // Methods in Molecular Biology // ; Book chapter 39 -Whole Body Regeneration ; O. Croce & E. Rottinger - [[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03437921/|HAL]]
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   * External expert for CSU of ISA ("Comité Scientifique Utilisateurs" bioinformatics @ Institut Sophia Agrobiotech / INARe).   * External expert for CSU of ISA ("Comité Scientifique Utilisateurs" bioinformatics @ Institut Sophia Agrobiotech / INARe).
 +  
 +  * Member of the IRCAN lab council : 1 elected seat (ITA representative) + as responsible of service
      
   * Teaching at the University Côte d'Azur since 2006 until now (50-60 hrs/year, for 3 Masters).   * Teaching at the University Côte d'Azur since 2006 until now (50-60 hrs/year, for 3 Masters).
  
-  * Other attached networks: scientific comity of Bioinfo-Unica, Admin06, BIOTIC network (BIOinformaTIque en provenCe)+  * Other attached networks: SFBI, Bioinfo-Unica 
  
 //Past commitments// //Past commitments//
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 == Current students trainees == == Current students trainees ==
-  __Pierre Marchal__ Ecole ingénieur agronome5e année (ENSAT) Co-responsible : Dorota Czerucka (centre scientifique de Monaco), stage via LIA-ROPSE (UCA / CSM) - 2023 - \\ //Identification et étude de l’expression des facteurs de virulence des bactéries pathogènes pour l’homme en milieu marin : approche bio-informatique// + 
-   +  __Léa David___ Master 2 Sciences de la vie & de la santéparcours BBC - UniCA - 2023-2024 co-responsible D. Czerucka (CSM / Monaco) LIA-ROPSE\\ // Bacterial shotgun metagenomic analysis using new R10 Nanopore technology // 
-  * __Emmanuelle Kulhanek Fontanille__ - Master 2 Sciences de la vie & de la santé, parcours BIM - UCA - 2023-2024 \\ //Détection de signatures dans les données brutes de séquençage//+ 
 +  * __Emmanuelle Kulhanek Fontanille__ - Master 2 Sciences de la vie & de la santé, parcours BIM - UCA - 2022-2024 \\ //Détection de signatures dans les données brutes de séquençage// 
 + 
 +  * __Mathieu Ferraud__ - PolyTech' Nice-Sophia engineer school (5th yr, Artificial Intelligence) - co-responsible E. Rottinger (IRCAN team)\\ //Structuring and manipulating multi-omics data underlying the extreme regeneration process //
  
 == Alumni == == Alumni ==
 +
 +  * __Pierre Marchal__ - Ecole ingénieur agronome, 5e année (ENSAT) - Co-responsible : Dorota Czerucka (centre scientifique de Monaco), stage via LIA-ROPSE (UCA / CSM) - 2023 - \\ //Identification et étude de l’expression des facteurs de virulence des bactéries pathogènes pour l’homme en milieu marin : approche bio-informatique//
 +  
   * __Mariem Ben Kheder__ - Bioinformatics PhD -  Aix-Marseille University & IHU Infection pôle Sud Méditerrannée  - co-responsible : R. Ruimy, JM Rolain -  2019 -2021 \\ //Séquençage haut débit pour le diagnostic et le traitement des infections bactériennes//   * __Mariem Ben Kheder__ - Bioinformatics PhD -  Aix-Marseille University & IHU Infection pôle Sud Méditerrannée  - co-responsible : R. Ruimy, JM Rolain -  2019 -2021 \\ //Séquençage haut débit pour le diagnostic et le traitement des infections bactériennes//
      
contacts/croce/croce.txt · Last modified: 2024/05/28 16:09 by olivier