bioinfomed

Ce module propose d'apporter les bases informatiques nécessaires au métier d'ingénieur en biomédical. Il se compose de 28 heures d'enseignements réparties en proportions égales entre cours magistraux et travaux dirigés. Ces enseignements ne demandent pas de pré-requis particuliers en informatique, mais l'étudiant devra toutefois être à l'aise avec l'outil informatique. Les concepts du codage numérique de l'information sont d'abord abordés, suivis d'une introduction au fonctionnement des réseaux informatiques et d'Internet. Le langages de programmation C++ est ensuite traité pour une large part du module. Les bases de la programmation C++ sont repris et développées jusqu'à savoir faire des programmes pour modifier des fichiers textes ou des fichiers d'images médicales (format Dicom). Le module s'achève par la réalisation d'un projet noté s'appuyant sur les compétences nouvellement apprises. Ce projet a pour objet la réalisation d'un programme répondant à un problème de biomédical imaginé, mais pouvant survenir réellement dans la vie professionnelle.

• 1/9 (+3h) - Lundi 9 Octobre (9h-12h) - Le codage de l'information
• 2/9 (+6h) - Lundi 16 Octobre (9h-12h) - Réseaux
• 3/9 (+9h) - Lundi 23 Octobre (9h-12h) - Algo - C++
• 4/9 (+12h) - Lundi 6 Novembre (9h-12h) - C++
• 5/9 (+15h) - Lundi 13 Novembre (9h-12h) - C++
• 6/9 (+18h) - Lundi 20 Novembre (9h-12h) - C++
• 7/9 (+21h) - Lundi 27 Novembre (9h-12h) - C++
• 8/9 (+24h) - Lundi 4 Décembre (9h-12h) - C++ / manipulation de fichiers (Salle M2-8)
• 9/9 (+28h) - Lundi 11 Décembre (9h-12h) - Le format Dicom / projets (Salle C12)

Les cours et les TD se déroulent dans la salle “Licence pro Dosi” (bâtiment M) en septembre. Salle C12 (bâtiment chimie, 1er étage) tout novembre. Enfin en Décembre - à déterminer-. . Vous devez prendre votre ordinateur portable (accès Internet wifi en utilisant les identifiants de la carte étudiants).

• Le codage de l'information
• Les réseaux informatiques
• Algorithmique et programmation
• C++
• Les fichiers en biomédical (Dicom)

• TD1 - Algo et réseaux
• TD1 - C++, les variables
• TD2 - C++, les structures conditionnelles
• TD3 - C++, les boucles
• TD4 - C++, tableaux de char, fonctions, tableaux statiques
• TD5 - C++, Manipulation des fichiers

Vous serez évalué sur un projet d'informatique médical / bioinformatique. Il y aura 2 notes qui auront les mêmes coefficients.

Pour la première note, il s'agira de rédiger, de manière individuelle, un projet d'informatique. Ce projet proposera une problématique qui pourrait être réelle et qui peut être résolu (ou aidé/amélioré) au moyen d'un programme informatique écrit en C++. Le sujet du projet est libre avec toutefois un lien direct avec le domaine de votre formation, c'est à dire le biomédical. Il y a sur ce site des exemples de projets proposés par la promotion des M1 GBM de l'année dernière (lien en dessous).
Chaque projet doit être envoyé par email à mon adresse olivier.croce@gmail.com avant le vendredi 8 décembre à 0h. Les projets devront être écrits individuellement et sont personnels (créés uniquement par vous, pas de consigne reprise du net ou d'un autre étudiant par exemple…). La note tiendra compte de la cohérence du projet et de la clarté de son énoncé, sa faisabilité (ni trop dur, ni trop facile), de son originalité.

Ensuite, le lundi 11 décembre pour notre dernier cours, j'attribuerai la moitié des projets, à des binômes que vous aurez constitués. Évidement, ces projets seront attribués à ceux qui ne les ont pas écrit eux-mêmes.
Il faudra rédiger un petit cahier des charges, éventuellement un organigramme/algorithme (le tout dans un .pdf ou .doc ou .odt) et bien sûr le programme lui-même en C++ (fichiers sources et exécutables mis dans un .zip unique).
Les projets seront ensuite à rendre pour le vendredi 2 février 0h, puis notés. Cette deuxième note sera donc la même pour les 2 personnes des binômes.

Bon courage.

• Exemples projets 2015/2016
• Exemples projets 2016/2017
• projets 2017/2018